澳门·新葡萄新京6663基础医学实验教学中心成立于2006年，中心遵循“以人为本，整合培养，求是创新，追求卓越”的教育理念，承袭医学院形态实验中心、机能实验中心、分子与细胞生物学实验中心和“国家理科基础医学人才培养基地”实验室的建设和改革成果，努力建设国家实验教学示范中心。2007年，建成浙江省实验教学示范中心。

基础医学实验教学中心实验大楼使用面积7420平方米，中心配备了各类性能优良的常规实验仪器，还配备了一批大型仪器：血气分析仪、全套先进的切片仪器、高效液相色谱仪、多功能细胞分析仪、全波长酶标仪等，仪器价值2960万元。

基础医学实验教学中心下设人体解剖学、病理学与组织学、生理学与药理学、生物化学与遗传学、病原生物学与免疫学5个综合性教学实验室，面向医学院、药学院、理学院9个专业的本科生、留学生及硕士和博士研究生开设19门实验课程，年教学人时数近19.7万。

澳门·新葡萄新京6663基础医学实验教学中心是目前国内办学层次最高、实验教学环境最好、国际化程度较高的基础医学实验教学中心之一。